台湾渔业署消息：针对媒体报道有部分人士担忧ECFA对台南石斑鱼产业的冲击案，渔业署表示，石斑鱼为国内重点养殖鱼种，并已列入农委会“精致农业健康卓越方案”，及逐年推动相关措施，展望在2013年达到石斑鱼产值倍增的目标，因此首先在2008年5月30日松绑法令并核准第一艘活鱼搬运船可搬运至香港销售，并伴随政府开放活鱼搬运船直航大陆，虽已大幅扩大外销数量，但仍面临销售大陆水产品需要10.5%关税之成本影响，故石斑鱼列入早收清单后，得以免除关税，可降低产销成本，提升产业竞争力。
渔业署说明，石斑鱼以海水养殖为主，台湾无论在种鱼培育或繁养殖技术，均居世界领先地位及优，因应鱼病对产业之冲击，政府亦积极投入疫苗之生产研发及结合防疫与产业分工，发展技术门坎较高之健康鱼苗之模块化生产，以进一步确保台湾所掌握的种苗优势。
台湾拥有越冬养殖石斑鱼的地理与气候优势，相较大陆因气候温度等因素无法全年生产，台湾更具竞争优势；另台湾较马来西亚、印度尼西亚等东南亚国家邻近市场，搭配2010年3月开放活鱼搬运船直航大陆11个港口，业者可依据市场需求及各项水产品特性客制化生产并调配稳定供货，创造更高的产业价值。 另为创造更佳之石斑鱼生产环境，降低对地下水的依赖，渔业署持续投入养殖区海水统筹供应系统及排水的设施改善工程，2010年至2011年间，将再投入1500万余元继续推动主要养殖区海水统筹供应，以提高石斑鱼质量及进一步增加养殖面积与产量。
渔业署强调，两岸签订ECFA后，部分业者已赴大陆投资布局，为减低投资大陆可能的风险，建议业者应配合产业政策将关键技术留在台湾，并查询是否为政府准许的投资项目，了解合约内容与土地法规等规定，多方听取当地台商一件并做好查证，最好能先洽询财团法人海峡交流基金会及行政院大陆文员会了解大陆投资保障相关法规与协助事项，以保障自身权益。另政府已经开始着手协商及争取尽快在下次江陈会讨论签订投资保障协议，更进一步保障台湾产业及业者的权益。
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